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    Como para toda doença, há três níveis de prevenção dos defeitos congênitos que são úteis para propor estratégias preventivas. Porém, eles não são conceitos absolutos e a prevenção secundária pode também evitar complicações, como acontece com as cirurgias pré-natais.
    Prevenção Primária: age em pessoas sadias, evita a doença reduzindo a susceptibilidade ou a exposição ao fator de risco. Seu tempo é principalmente pré-concepcional e evita os defeitos congênitos.
    Prevenção Secundária: age em pessoas doentes, evita a evolução e sequela da doença através da detecção precoce e o tratamento oportuno. Seu tempo é principalmente pré-natal e evita as crianças defeituosas: p.ex. diagnóstico pré-natal seguido de interrupção da gravidez (frequentemente) ou de tratamento, como na cirurgia intra-uterina da hidronefrose.
    Prevenção Terciária: age em pessoas doentes, evita as complicações da doença através da reabilitação e correção adequadas. Seu tempo é principalmente pós-natal e evita as complicações.
    Mausner JS, Kramer S (1985) Mausner & Bahn Epidemiology: An Introductory Text. W.B.Saunders Co., Philadelphia.