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C 型肝炎病毒 的類種性特質 （Quasispecies nature）使得它產生具有許多生物學上的特徵，例如：持續性感染、抵抗抗病毒藥劑及不能製造出有效的疫苗。它在 E2/NS1 區域具有高度變異性，有人認為這就是使它具有類種性特質的原因。