Los antígenos internos ( proteínas M1 y NP) son proteínas específicas a tipo (antígenos específicos a tipo) usados para determinar si un virus en particular es A, B o C. Las proteínas M1 de todos los miembros de cada tipo muestran reactividad cruzada. Las proteínas NP de todos los miembros de cada tipo, también muestran reactividad cruzada.

Los antígenos externos (HA y NA) muestran mayor variación  y son antígenos específicos para cepa y subtipos. Estos son usados para determinar si una cepa de influenza A en particular es responsable de un brote.

Cepas de gripe don llamadas por sus tipos de proteínas de superficie hemaglutininas y neuraminidasa, así pueden ser llamadas, por ejemplo H3N2, para hemaglutinina tipo 3 y neuraminidasa tipo 2.

Si dos cepas diferentes de influenza infectan a la misma célula simultáneamente, las cápsides de  proteína y la cubierta de lípidos son removidas, con exposición de su RNA el cual luego, es trascrito al RNA mensajero.

Loa célula del huésped, forma nuevos virus q1ue combinan antígenos; por ejemplo, H23N2 y H5N1 pueden formar H5N2, de esta forma.

Debido a q1ue el sistema inmune del hombre tienen dificultad para distinguir la nueva cepa de influenza, puede ser altamente peligroso.