Los virus Influenza A se encuentran en diferentes animales, incluyendo patos, pollos, cerdos, ballenas, caballos y focas.

Hay 16 diferentes subtipos de hemaglutininas y 9 subtipos de neuroaminidasas, todos los cuales se han encontrado en virus Influenza A en aves silvestres.

Aves silvestres son el reservorio natural primario de todos los tipos de virus Influenza A y se cree que sean la fuente de virus Influenza A en todos los demás animales.

La mayoría de los virus influenza causan infecciones leves o asintomáticas en aves; sin embargo, el rango de síntomas en aves varían grandemente, dependiendo de la cepa del virus.

Infecciones con ciertos virus Influenza A (por ejemplo, algunas cepas de virus H5 y H7) pueden causar diseminación de la enfermedad y muerte entre algunas especies de aves silvestres, y especialmente domésticas, tales como pollos y pavos.

Cerdos pueden infectarse con virus Influenza aviar o humana, además del virus Influenza porcina. Cerdos infectados tienen síntomas similares  a humanos, tales como tos, fiebre y rinorrea. 

Debido a que los cerdos son susceptibles a virus influenza aviar, humana o porcina, ellos potencialmente pueden infectarse con virus de la influenza de diferentes especies (por ejemplo, patos y humanos) al mismo tiempo. Si esto sucede, es posible que los genes de los virus se mezclen y generen un nuevo virus.