Los virus de la influenza A se encuentran en diferentes animales, incluyendo patos, pollos, cerdos, ballenas, caballos y focas.

Hay 16 subtipos diferentes de hemaglutininas y 9 subtipos diferentes de neuraminidasas, todos encontrados en los virus en aves silvestres.

Las aves silvestre son el reservorio natural primario de todos los subtipos de virus de la influenza A y se piensa que sean la fuente de virus de la influenza A en los demás animales.

La mayoría de los virus de la influenza causan infección leve o asintomática en aves; sin embargo, el rango de síntomas en aves varía mucho, dependiendo de la cepa de los virus.

La infección con ciertos virus de la influenza aviar A (por ejemplo, algunas cepas H5 y H/)pueden causar diseminación amplia de la enfermedad y muertes en algunas especies de aves silvestres y domésticas, como pavos y pollos.

Cerdos pueden ser infectados con virus de la influenza humana y aviar además de los virus de la influenza de los cerdos. Cerdos infectados tienen síntomas similares a los humanos, como tos, fiebre y rinorrea.

Debido a que cerdos son susceptibles a los virus de la influenza aviar, humana y de los cerdos, ellos pueden ser potencialmente infectados con virus de la influenza de diferentes especies (por ejemplo, patos y humanos) al mismo tiempo. Si esto sucede, es posible que los genes de esos virus se mezclen y puedan crear un nuevo virus.