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候鸟在高度致病性禽流感病毒（HPAI）中的作用还未完全阐明。
野生水鸟被认为是所有A型流感病毒（包括H5和H7亚型）的自然储存库。
相当多的旁证显示候鸟可以将低度致病性H5和H7病毒引入家禽，从而突变为高度致病性形式。
过去，高度致病性病毒曾经在很罕见的几只候鸟中分离出来，它们通常都已经在家禽爆发的飞行航线内死亡。
这个发现显示野生水鸟并不是这些病毒传播的媒介。
然而近来的事件更可能的显示现在候鸟直接扩散高度致病性的H5N1病毒。预计还会进一步扩散到新的地区。